Πάνω από 500.000 επιχειρήσεις και ελεύθεροι επαγγελματίες, που είτε δεν αποδέχτηκαν τα εκκαθαριστικά σημειώματα περαίωσης τα οποία τους έστειλαν οι υπηρεσίες του υπουργείου Οικονομικών για να περαιώσουν αυτόματα τις φορολογικές εκκρεμότητες των ετών 2000 - 2009, είτε εξαιρέθηκαν απ’ αυτήν τη διαδικασία της αυτόματης περαίωσης, επειδή κατείχαν μεγάλης αξίας ακίνητη περιουσία ή για άλλους λόγους που είχαν καθοριστεί ρητά, πρόκειται να ελεγχθούν με συνοπτικές διαδικασίες για τις χρήσεις 2000 - 2009.

Οι υποθέσεις αυτές θα ελεγχθούν προκειμένου να διαπιστωθεί:

- Αν τηρήθηκαν τα βιβλία και στοιχεία που προβλέπονται από τον ΚΒΣ, κατά περίπτωση, για το κεντρικό και τα υποκαταστήματα.
- Αν τα βιβλία τηρήθηκαν σύμφωνα με τις διατάξεις του ΚΒΣ.
- Αν για τον προσδιορισμό των καθαρών κερδών εφαρμόστηκαν οι κείμενες κατά περίπτωση διατάξεις.
- Αν σε ετήσια βάση και σε επιχειρήσεις με ετήσιο κύκλο εργασιών έως 1.500.000 ευρώ τα ακαθάριστα έσοδα που προκύπτουν από τις φορολογικές ταμειακές μηχανές συμφωνούν με τις αντίστοιχες καταχωρίσεις στα τηρούμενα βιβλία.
- Αν για τις παραγωγικές επενδύσεις και τις αφορολόγητες κρατήσεις των αναπτυξιακών νόμων έχουν εφαρμοστεί οι κείμενες διατάξεις.
- Αν υπάρχουν βεβαιωμένες και ληξιπρόθεσμες οφειλές.
- Αν έχει γίνει αγορά αγαθών ή λήψη υπηρεσιών από εξωχώρια εταιρία.
- Αν υπάρχουν παραβάσεις ΚΒΣ ή άλλα έγγραφα από τα οποία προκύπτει φοροδιαφυγή ή επηρεάζεται το κύρος των βιβλίων και στοιχείων.
- Αν εκδόθηκαν ή ελήφθησαν εικονικά φορολογικά στοιχεία καθώς και αν εκδόθηκαν πλαστά φορολογικά στοιχεία.

Στους τηρούντες βιβλία Β΄ κατηγορίας, οι πιο σημαντικές ελεγκτικές επαληθεύσεις θα είναι οι ακόλουθες:

- Αν τα δεδομένα του βιβλίου εσόδων - εξόδων μεταφέρθηκαν επακριβώς στα έντυπα που συνοδεύουν την ετήσια δήλωση φορολογίας εισοδήματος και στις λοιπές δηλώσεις.

- Όπου έχει διενεργηθεί απογραφή, θα πραγματοποιείται κλειστή αποθήκη σε ένα τουλάχιστον είδος επιλεκτικά με βάση την τιμή μονάδας ή την ποσότητα ή τη συνολική αξία, υποχρεωτικά σε όσους πωλούν αποκλειστικά χονδρικώς και όπου είναι εφικτό στις επιχειρήσεις που πωλούν χονδρικώς και λιανικώς ή αποκλειστικά λιανικώς.

- Έλεγχος κάθε δαπάνης που υπερβαίνει τα 700 ευρώ. Όσες από τις δαπάνες αυτές δεν αναγνωρίζονται για έκπτωση από τα ακαθάριστα έσοδα, σύμφωνα με τις κείμενες διατάξεις, θα προστίθενται ως λογιστικές διαφορές. Εξαιρετικά, ελέγχονται ανεξαρτήτως ποσού τα έξοδα ταξιδίων, υποδοχής και φιλοξενίας, οι δαπάνες κινητής τηλεφωνίας, οι δαπάνες που αφορούν σε επιβατικά αυτοκίνητα, οι δαπάνες μισθοδοσίας και οι αποσβέσεις.

Κατά τον έλεγχο των ελεύθερων επαγγελματιών:

-Θα γίνεται επαλήθευση της ορθής μεταφοράς της αξίας των εκδοθέντων στοιχείων εσόδων στο βιβλίο εσόδων - εξόδων κατά τους μήνες Ιούλιο και Δεκέμβριο κάθε έτους. Σε περίπτωση μη ύπαρξης αμοιβών κατά τους ανωτέρω μήνες, οι πιο πάνω επαληθεύσεις θα διενεργούνται ανάλογα στους αμέσως προηγούμενους αντίστοιχα μήνες στους οποίους υφίστανται αμοιβές.

- Θα ελέγχονται όλες οι δαπάνες που υπερβαίνουν το ποσό των 300 ευρώ. Όσες από τις δαπάνες αυτές δεν αναγνωρίζονται για έκπτωση από τις ακαθάριστες αμοιβές, σύμφωνα με τις κείμενες διατάξεις, θα προστίθενται ως λογιστικές διαφορές. Ιδιαίτερη έμφαση θα δίνεται στη διαπίστωση τυχόν εικονικών φορολογικών στοιχείων ή δαπανών που στην πραγματικότητα δεν αφορούν στην άσκηση της επαγγελματικής δραστηριότητας ή δαπανών που δεν καλύπτονται με νόμιμα παραστατικά. Εξαιρετικά, θα ελέγχονται ανεξαρτήτως ποσού τα έξοδα ταξιδίων, υποδοχής και φιλοξενίας, οι δαπάνες σταθερής και κινητής τηλεφωνίας καθώς και οι δαπάνες που αφορούν σε επιβατικά αυτοκίνητα.

- Θα γίνεται επαλήθευση αν τα δεδομένα του βιβλίου εσόδων - εξόδων μεταφέρθηκαν επακριβώς στα έντυπα που συνοδεύουν τις δηλώσεις φορολογίας εισοδήματος.

- Έλεγχος «συνάφειας»: Θα ελέγχεται εάν τα δηλωθέντα ακαθάριστα έσοδα βρίσκονται σε συμφωνία με τα λοιπά οικονομικά μεγέθη κατ’ ανάλογη εφαρμογή των όσων ορίζονται στην παράγραφο για τις επιχειρήσεις παροχής υπηρεσιών.

Έλεγχος ΦΠΑ

Ειδικά για τον ΦΠΑ, θα ελέγχεται κυρίως:

α. Αν τα δεδομένα των βιβλίων συμφωνούν με τα αντίστοιχα ποσά της εκκαθαριστικής δήλωσης της οικείας διαχειριστικής περιόδου.

β. Αν για δαπάνες αξίας μεγαλύτερης:

- των 300 ευρώ προκειμένου για ελεύθερους επαγγελματίες,
- των 700 ευρώ προκειμένου για βιβλία Α΄ και Β΄ κατηγορίας,
- των 1.000 ευρώ προκειμένου για βιβλία Γ΄ κατηγορίας και ακαθάριστα έσοδα έως 1.500.000 ευρώ,
- των 2.000 ευρώ προκειμένου για βιβλία Γ΄ κατηγορίας και ακαθάριστα έσοδα πάνω από 1.500.000 και έως 9.000.000 ευρώ και
- των 5.000 ευρώ για βιβλία Γ΄ κατηγορίας και ακαθάριστα έσοδα άνω των 9.000.000 ευρώ,
… για τις οποίες έχει εκπέσει ΦΠΑ, υπάρχουν τα νόμιμα δικαιολογητικά και παρέχεται γι' αυτές δικαίωμα έκπτωσης του αναλογούντος ΦΠΑ.

γ. Αν τυχόν πιστωτικό υπόλοιπο ΦΠΑ μεταφέρθηκε για συμψηφισμό χωρίς να υπάρχει δικαίωμα, λόγω παραγραφής του κατά τις ισχύουσες διατάξεις.

δ. Προκειμένου για απαλλασσόμενες πωλήσεις, αν έχουν τηρηθεί οι προβλεπόμενες διαδικασίες και αν υπάρχουν τα αντίστοιχα δικαιολογητικά.

ε. Αν επί πωλήσεων αγαθών σε περιοχές με μειωμένους συντελεστές πληρούνται οι προϋποθέσεις που ορίζονται από τις κείμενες διατάξεις και τις σχετικές εγκυκλίους, για φορολογικά στοιχεία αξίας άνω των 3.000 ευρώ.

Για ελεγχθείσες με βάση την απόφαση του υπουργείου Οικονομικών χρήσεις, για τις οποίες θα επέρχεται επίλυση όλων ανεξαιρέτως των φορολογικών διαφορών που προέκυψαν από τον έλεγχο, θα πρέπει να καταβάλλεται συγχρόνως με την επίλυση ή το αργότερο εντός των δύο επόμενων εργάσιμων για τις ΔΟΥ ημερών το 1/5 - 1/10 του συνόλου των οφειλόμενων ποσών.

Τα υπόλοιπα ποσά, ανεξαρτήτως είδους φορολογίας, θα βεβαιώνονται και θα καταβάλλονται ανάλογα με το ύψος του συνολικού ποσού της οφειλής, ως εξής:

α. Σε 12 ίσες μηνιαίες δόσεις, αν η συνολική οφειλή είναι μέχρι και 25.000 ευρώ.
β. Σε 18 ίσες μηνιαίες δόσεις, αν η συνολική οφειλή είναι πάνω από 25.000 ευρώ και μέχρι 50.000 ευρώ.
γ. Σε 24 ίσες μηνιαίες δόσεις, αν η συνολική οφειλή είναι πάνω από 50.000 ευρώ και μέχρι 100.000 ευρώ.
δ. Σε 30 ίσες μηνιαίες δόσεις, αν η συνολική οφειλή είναι πάνω από 100.000 και μέχρι 150.000 ευρώ.
ε. Σε 36 ίσες μηνιαίες δόσεις, αν η συνολική οφειλή είναι πάνω από 150.000 ευρώ.

Σε κάθε περίπτωση, το ποσό κάθε δόσης δεν μπορεί να είναι κατώτερο από 300 ευρώ, εκτός από την τελευταία δόση.