Η εκλογή νέου διοικητικού συμβουλίου με τριετή θητεία και ο ορισμός των ανεξάρτητων μελών του αποφασίστηκε κατά τη συνεδρίαση της τακτικής γενικής συνέλευσης της Aegean Airlines στις 15 Μαΐου 2009.

Επίσης, σύμφωνα με σχετική ανακοίνωση, εκλέχτηκε νέα τριμελής επιτροπή ελέγχου, η οποία θα απαρτίζεται από τα εξής μέλη του Δ.Σ.:

α. κ. Κωνσταντακόπουλος Αχιλλέας - μη εκτελεστικό μέλος.
β. κ. Τσακτάνης Μάρκος - μη εκτελεστικό μέλος.
γ. κ. Μακρίδης Αλέξανδρος - ανεξάρτητο μη εκτελεστικό μέλος.

Το διοικητικό συμβούλιο συγκροτήθηκε σε σώμα κατά τη συνεδρίασή του, την 20ή Μαΐου 2009 και όρισε τα εκτελεστικά μέλη και μη εκτελεστικά μέλη του ως ακολούθως:

* κ. Βασιλάκης Θεόδωρος - πρόεδρος - εκτελεστικό μέλος.
* κ. Βασιλάκης Ευτύχιος - αντιπρόεδρος - εκτελεστικό μέλος.
* κ. Γερογιάννης Δημήτριος - διευθύνων σύμβουλος - εκτελεστικό μέλος.
* κ. Βασιλάκης Γεώργιος - μη εκτελεστικό μέλος.
* κ. Γεωργάνας Ιάκωβος - μη εκτελεστικό μέλος.
* κ. Δαυίδ Αναστάσιος - μη εκτελεστικό μέλος.
* κ. Ιωάννου Χρήστος - μη εκτελεστικό μέλος.
* κ. Κωνσταντακόπουλος Αχιλλέας - μη εκτελεστικό μέλος.
* κ. Λασκαρίδης Παναγιώτης - μη εκτελεστικό μέλος.
* κ. Μακρίδης Αλέξανδρος - ανεξάρτητο μη εκτελεστικό μέλος.
* κ. Πιζάντε Βίκτωρ - ανεξάρτητο μη εκτελεστικό μέλος.
* κ. Τσακτάνης Μάρκος - μη εκτελεστικό μέλος.