Αντικείμενο φορολογικού ελέγχου αποτελεί πλέον και η ορθή απόδοση του επίναυλου που επιβάλλεται στις μεταφορές, μετά τη γνωμοδότηση του Νομικού Συμβουλίου του Κράτους (Β΄ Τακτική Ολομέλεια) ότι ο επίναυλος του δέκατου άρθρου του ν.2932/2001 αποτελεί φόρο.

Σύμφωνα με τη ομόφωνη γνωμοδότηση του ΝΣΚ, η οποία έγινε αποδεκτή από τον υπουργό Οικονομικών «η είσπραξη του τυχόν οφειλόμενου επίναυλου επιδιώκεται κατά τις διατάξεις του ΚΕΔΕ, με νόμιμο τίτλο κατ’ άρθρο 2, παρ.2, περίπτ. β΄ αυτού, το προς βεβαίωση δε δικαίωμα του Δημοσίου για την είσπραξη του τυχόν οφειλόμενου επίναυλου παραγράφεται είκοσι έτη μετά τη γένεση της σχετικής αξίωσής του».

Όπως αναφέρεται σε σχετική εγκύκλιο του υπουργείου Οικονομικών, η ελεγκτική αρμοδιότητα για την ορθή απόδοση του επίναυλου και η αρμοδιότητα για τη συγκρότηση του σχετικού νόμιμου τίτλου, ανήκει στις αρμόδιες Δ.Ο.Υ.